Sykdommen forårsakes av Blastocystis spp, encellede protozoer, som spres med forurenset drikkevann i de fleste land, særlig i tropiske strøk.
Blastocystis påvises både hos asymptomatiske og symptomatiske personer, og det er kontroversielt om den forårsaker sykdom. Det er ikke påvist effekt av behandling, men ved diaré og magesmerter uten annen påvist etiologi kan man vurdere et behandlingsforsøk.
Påvisning av fargevariable runde cystelignende parasitter ved mikroskopi.
Ved uttalte symptomer og rikelig cyster kan man forsøke metronidazol, trimetroprim-sulfa eller paromomycin.